Le bras humain et l'aile d'une chauve-souris sont considérés comme des homologues car ils partagent une structure osseuse similaire, indiquant un ancêtre commun.
Le gène de la couleur des yeux chez les mouches à fruits est un homologue d'un gène qui contrôle le développement précoce du cerveau chez l'homme, ce qui montre leur histoire évolutive commune.